ctDNA精準(zhǔn)測(cè)序難點(diǎn)新突破

　　在3月6日-11日舉行的舊金山分子醫(yī)學(xué)三方會(huì)議（TheMolecularMedicineTri-Conference）上，安可濟(jì)（AccuraGen）公司的聯(lián)合創(chuàng)始人兼科研總監(jiān)趙奇志（GraceZhao）博士首次發(fā)表了安可濟(jì)獨(dú)創(chuàng)的ctDNA高通量測(cè)序技術(shù)FireflyTM的原理，及其和國(guó)際主流技術(shù)的性能比較，證明基于FireflyTM技術(shù)開發(fā)的基因液態(tài)活檢產(chǎn)品可能是目前國(guó)際上性能最好的ctDNA高通量測(cè)序產(chǎn)品。這意味著由中國(guó)海外學(xué)者創(chuàng)始的這家國(guó)際公司在腫瘤液態(tài)活檢領(lǐng)域走在了世界前列。
　　
　　日前，國(guó)際知名基因組專業(yè)網(wǎng)站GenomeWeb對(duì)此做了報(bào)道。舊金山分子醫(yī)學(xué)三方會(huì)議已有23年歷史，聚焦分子醫(yī)學(xué)，涵蓋新藥研發(fā)、基因組學(xué)、體外診斷、生物信息、商務(wù)策略、平臺(tái)開發(fā)等多領(lǐng)域，是診斷方法與新藥研發(fā)領(lǐng)域相關(guān)人士不可錯(cuò)過的一流國(guó)際盛會(huì)。
　　
　　液態(tài)活檢是腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域炙手可熱的明星技術(shù)。循環(huán)腫瘤DNA（ctDNA）高通量測(cè)序技術(shù)是液態(tài)活檢的一種，也是最具前景的。它只需像化驗(yàn)肝腎功能那樣采集靜脈血，即可對(duì)全身的腫瘤基因信息進(jìn)行精確測(cè)定，基于腫瘤基因信息，就可以指導(dǎo)抗腫瘤藥物選用、療效評(píng)估、預(yù)后判斷，甚至早期發(fā)現(xiàn)和早期診斷。然而，精確測(cè)序ctDNA存在兩個(gè)巨大技術(shù)障礙：首先是血漿中的ctDNA含量極低，做不了幾個(gè)檢測(cè)反應(yīng)。其次是二代測(cè)序背景噪聲很高，用常規(guī)建庫(kù)測(cè)序方法腫瘤信號(hào)完全淹沒在背景噪聲中。全球這一領(lǐng)域的頂尖高手都在致力于攻克這兩個(gè)難題。
　　
　　在3月11日的循環(huán)腫瘤DNA分會(huì)場(chǎng)上，趙奇志博士主持了會(huì)議，并報(bào)告了FireflyTM技術(shù)的原理與進(jìn)展。安可濟(jì)采用單鏈環(huán)化DNA滾環(huán)復(fù)制串聯(lián)重復(fù)確認(rèn)法，取代國(guó)際主流的雙鏈DNA分子條碼擴(kuò)增比對(duì)確認(rèn)法，在解決了微量的循環(huán)腫瘤DNA擴(kuò)增難題的同時(shí)極大地提高了檢測(cè)靈敏度和特異性?；谠摷夹g(shù)開發(fā)的涵蓋61個(gè)基因測(cè)序的安可行TM產(chǎn)品已經(jīng)完成了性能驗(yàn)證，正在中國(guó)推進(jìn)針對(duì)不同癌癥種類的6個(gè)臨床合作研究項(xiàng)目。臨床研究結(jié)果證明了在晚期肺癌病例中，ctDNA與組織測(cè)序98%病例符合率和高達(dá)87%位點(diǎn)符合率。通過對(duì)胰腺癌的近兩年的研究觀察，發(fā)現(xiàn)了ctDNA突變譜與預(yù)后和化療獲益率之間的相關(guān)性。在直結(jié)腸癌指導(dǎo)用藥研究中，發(fā)現(xiàn)了明確的ctDNA與療效和復(fù)發(fā)的相關(guān)性。這些研究成果已經(jīng)投稿今年六月的美國(guó)臨床腫瘤學(xué)會(huì)（ASCO）年會(huì)，也為下一步產(chǎn)品開發(fā)奠定了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。若干年前，蘋果創(chuàng)始人喬布斯花10萬(wàn)美金進(jìn)行腫瘤基因測(cè)序，還只能取材腫瘤組織活檢標(biāo)本，這在實(shí)際應(yīng)用中有很大局限。而只需采血的液態(tài)活檢則應(yīng)用極為方便。不僅如此，組織活檢像切蛋糕一樣，只檢測(cè)了腫瘤的一部分，而循環(huán)血中的ctDNA則能反映腫瘤全貌，這對(duì)全面了解腫瘤特征、精準(zhǔn)給藥提供了前所未有的視野。
　　
　　目前，兩年多年前初創(chuàng)于美國(guó)加州PaloAlto的安可濟(jì)公司已經(jīng)遷至MenloPark，形成了國(guó)際一流的研發(fā)團(tuán)隊(duì)，同時(shí)，在中國(guó)上海設(shè)立了首個(gè)醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)所和商業(yè)推廣機(jī)構(gòu)。據(jù)悉，該公司近期將有進(jìn)一步發(fā)展布局，十分值得期待。