雙向電泳儀有兩向電泳組成,第一向根據(jù)蛋白質(zhì)的等電點不同在pH梯度凝膠中進行等點聚焦,第二向根據(jù)蛋白質(zhì)的分子量大小不同在垂直方向或水平方向進行SDS-PAGE電泳。雙向電泳儀可以將2000~3000種蛋白質(zhì)進行分離。
一、蛋白質(zhì)組學研究:
1、蛋白質(zhì)組:
蛋白質(zhì)組是指一個細胞在特定生理或病理狀態(tài)下表達的所有種類的蛋白質(zhì)。
2、蛋白質(zhì)組學:
蛋白質(zhì)組學是指研究蛋白質(zhì)組的技術(shù)和這些研究所得到的結(jié)果,包括蛋白質(zhì)鑒定、翻譯后修飾及蛋白質(zhì)功能與疾病的關(guān)系。
3、蛋白質(zhì)組學研究的意義:
蛋白質(zhì)組學是連接基因、蛋白質(zhì)和疾病的紐帶,對蛋白質(zhì)表達變化或差異分析將具有重要的生物學意義和醫(yī)學應(yīng)用價值,為闡明生命現(xiàn)象的本質(zhì)奠定基礎(chǔ)。
4、蛋白質(zhì)組學研究所面臨的困難:
(1)細胞種類的多樣性。
(2)細胞的生命周期。
(3)蛋白質(zhì)生成的時效性。
(4)蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和變異。
(5)研究方法。
5、雙向電泳的重要性:
原位細胞提取與樣品處理-雙向電泳-質(zhì)譜的技術(shù)路線是一條典型的蛋白質(zhì)組學研究的技術(shù)路線。
雙向電泳是研究蛋白組學的關(guān)鍵技術(shù),是深刻認識蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能的重要工具。
二、雙向電泳工作原理:
雙向聚丙烯酰胺凝膠電泳(2D-PAGE)是結(jié)合等電聚焦電泳(根據(jù)蛋白質(zhì)等電點進行分離)和SDS-PAGE電泳(根據(jù)蛋白質(zhì)的大小進行分離)而形成的二維電泳,是分離分析蛋白質(zhì)最有效的電泳手段。
通常第一向電泳是等電聚焦電泳,在細管中(Ф1~3mm)中加入含有載體兩性電解質(zhì)、8M的脲酶和非離子型去污劑的聚丙烯酰胺凝膠進行等電聚焦,變性的蛋白質(zhì)根據(jù)其等電點的不同進行分離。然后將凝膠從管中取出,用含有SDS的緩沖液處理30min,使SDS與蛋白質(zhì)充分結(jié)合。將處理過的凝膠條放在SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳的濃縮膠上,加入丙烯酰胺溶液或熔化的瓊脂糖溶液,使其固定并與濃縮膠連接。在第二向電泳中,結(jié)合SDS的蛋白質(zhì)從等電聚焦凝膠中進入SDS-聚丙烯酰胺凝膠,在濃縮膠中被濃縮,在分離膠中依據(jù)其分子量大小被分離。這樣各個蛋白質(zhì)根據(jù)等電點和分子量的不同而被分離。
三、雙向電泳主要步驟:
雙向電泳是一項技術(shù)性很強并且很辛苦的工作。
1、樣品準備。
2、第一向形成pH梯度進行等電聚焦電泳。
3、第二向進行SDS-PAGE電泳。
4、考馬氏亮蘭染色或銀染色。
5、肉眼觀察或自動掃描,進行電泳圖分析。
四、雙向電泳存在的問題:
1、重復性差:方法尚未標準化,導致不同實驗室之間的結(jié)果難以重復。
2、定量困難。
五、雙向電泳的進展:
1、雙向平板電泳的進展:
(1)染色試劑有考馬氏亮蘭、銀染、同位素和熒光等。
(2)由染色檢測到直接紫外檢測。
(3)肉眼觀察到自動掃描。
2、由雙向平板電泳到雙向毛細管電泳(雙向柱電泳):
(1)第一向為毛細管等電聚焦電泳。
(2)第二向為毛細管區(qū)帶電泳。
3、由雙向平板電泳到雙向芯片電泳。
4、由雙向平板電泳到多維電泳。
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